在中国，想要合法经营一家针灸理疗门诊，需要具备一系列相关的资质和证件，以下是一些必备的证书和许可：

1、医疗机构执业许可证：这是开设任何医疗相关机构的基本前提，需要向当地卫生行政部门申请。

2、医师资格证书：所有从事针灸实践的医生都必须持有有效的医师资格证书，以证明他们具有进行医疗实践的资格。

3、医师执业证书：除了医师资格证书外，医生还需要获得医师执业证书，该证书允许他们在特定的医疗机构内执业。

4、针灸专业资格证书：由于针灸是一门专业技术，从业者需通过专业的针灸培训，并获得相应的专业资格证书。

5、营业执照：作为一家合法的商业实体，针灸理疗门诊还需向工商行政管理部门申请营业执照。

6、税务登记证：为了确保能够依法纳税，必须办理税务登记并获取税务登记证。

7、社会保险登记证：作为雇主，门诊需要为员工缴纳社会保险，因此需要进行社会保险登记。

8、环境评估报告：根据当地法律要求，可能需要提交环境影响评估报告，以证明门诊的运营不会对周围环境造成不利影响。

9、消防安全证明：门诊场所必须符合消防安全标准，并通过消防部门的审核。

10、药品和医疗器械经营许可证：如果门诊涉及药品和医疗器械的销售，还需要取得相应的药品和医疗器械经营许可证。